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根莖類蔬菜，除了基本的栽培田之管理須注意到土壤類有機質應供給充足，使土壤呈現鬆軟透氣的團粒結構，以利根系在發展上所需的理化性的調整；確實的營養鹽類的供給，以利不同發育時期的生長需等兩件重要的基本的管理前期作業以外，生長發育期間可以額外提供不同的萃取物質之營養劑，以利根莖類蔬菜在發育期間的生育調整。例如發芽初期第二至三枚本葉期間，提供以植物生長素（AUXINS）為主的海藻精一次，可以幫助苗株根系的發育，並且在生長期間施用胺基酸等營養劑，以利根莖品質的提升。
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根莖類蔬菜在栽培初期的生長管理， 應該注意到土壤性病害的危害，應該按照推薦用藥進行定期防治；雖然大部分的蔬菜作物在生長初期需要施予足夠的氮素肥料，以助指數生長期間，苗株生長發育所需要的營養，雖然植株的擴大與採後的品質有相對關係，但是過多的氮素可能會造成植體組織較為不堅韌，易使作物感染病害或蟲害，所以亦要注意到營養管理應該是整體性的。為了避免植株的結構性較為差，適當的補充鉀與鈣素是有其必要的，而且根莖類作物在後期生長上，更需注意到鉀的供給。
根莖類蔬菜在初期生長情況，依照不同科別作物而有差異。如十字花科的根莖類蔬菜初期發育較為快速，並且隨著栽培時間增加，根莖部位即越趨壯實。所以一般的十字花科蔬菜對於肥料的攝取需求也較為大，初期應該注意到氮素供給應該避免發生缺乏的情況，以增加指數生長期間的快速營養生長的所需的養分，並且應該要注意到是否有硼素缺乏的問題，應該在整地初期即應該補充足夠的硼砂，或者在生長期間使用水硼做追肥，以避免因為缺硼造成的莖裂問題，才不會使得農產品的採收品質變差。
在台灣常見的根莖類蔬菜分有蘿蔔、胡蘿蔔、馬鈴薯、甜菜根等；另外歸屬在農藝作物的薯蕷類之芋頭、甘藷的栽培上有時候會一起討論。蔬菜類的根莖作物為了日後的採收品質，一般都是建議利用種子直播在畦面上後即不再移植，由於整個栽培時間通常會拉到80-120天不等，所以根莖類蔬菜在播種前的田間整地作業的準備工作通常會更甚於一般的短期蔬菜，戶外大田在整地後為了利於作物根系的發育，有機質補充是需要的，並且應該依照生長與結薯（結球）等不同生育期作肥培管理的調整。
因此可以知道，氮素在大量供應的栽培條件下，對於結球類的蔬菜，例如甘藍可以增加葉面積，但在快速生長發育的情況下，對於增強結構性組織的鈣成分亦要緊跟著追加，以避免發生因為元素缺乏所造成的結構崩壞徵狀，例如葉頂燒的問題。另外有多種蔬菜對於硼元素缺乏較為敏感，容易發生新梢葉片縮緬或是莖部因為缺硼而造成莖部開裂，所以硼素的施用是必須的。大部分的農民可能會在整地、翻土、做畦的時間會順便施用硼砂等不同含硼元素的各式營養劑或肥料，以提高土壤中硼的含量。