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在低溫期間，胺基酸營養劑亦是可以提高作物抗逆境的能力，主要是有多種氨基酸的成分與生物荷爾蒙合成的前驅物或啟動酶，植物荷爾蒙的生成又與植物生長發育能力有很大的關係，舉凡發根、長葉、開花與果實發育都與植物荷爾蒙的生成有極大的關係。而低溫期間除了可以透過高氮素的供給與植物，使其吸收效能較高以外，對於多種台灣常見的亞熱帶或熱帶之果樹作物，可以在低溫特報發布前7天左右，提高鉀肥的供給，若遇到連續低溫又乾旱的氣候下，鉀肥的供給確實可以提高作物的抗逆能力。
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為了提高低溫時期作物對氮元素的攝取，適量的提高氮素的供給是必要的，但是低溫期間若遇到照度較低的氣候，仍然要注意氮肥造成徒長的問題；而氮肥的供給來源，除了一般常見的礦物型氮素以外，生物型氮素來源也是一種極佳的選擇。生物型的氮素來源，即是常見的各種氨基酸營養劑或肥料，尤其是營養劑的使用上，除了可以補充氮素以外，氨基酸因為具有類似生物激素的功能，所以有助低溫期間吸收效能，根系發展的作用。另外透過生物型或礦物型氮素的比例調整，更可以達到最佳氮吸收效力。
而低溫期間，因為作物的生物效應較為緩慢，對於土壤內的礦物營養吸收效果較差，尤其是運移速度較差的鈣、磷與多種微量元素，雖然冬天因為氣溫低，作物因為代謝速度慢，所以在元素缺乏徵狀的產生或發生率通常也比夏季不明顯，而冬季會產生的元素缺乏問題也與夏季有些差異，例如夏季較易缺鎂而冬季較易缺鐵，所以不管是夏季或是冬季的栽培期間，可以透過使用綜合微量元素來預防多種缺乏症狀的發生。而為了提高冬季作物的抗寒能力以及採收後的運輸傷害，可以提高鉀素的施用來提升。
冬天氣溫低，可能造成作物對氮肥的攝取效力降低，而在低溫低照度的栽培期間，又容易因為低照度，造成作物產生徒長的問題；而因為冬季對於南台灣等主要的農業生產地區是旱季，而作物在吸收肥料又需要水分的共同攜伴帶往植物體內，所以冬季的肥料施用上，需注意到水分的供給是否充足，並且為了彌補土壤內肥料由根部吸收的效率下降，可以透過施用葉面肥的方式補充，使得肥料的使用更節省，而利用葉面肥的施用，可以加大作物的整體吸收面積，促進作物可以得到更充分的營養，是不可輕忽的管理方式。
而正確的使用亞磷酸，才能使亞磷酸的效力達到最佳效能；不正確的施用方式並無法完全發揮到亞磷酸該有的功能，頂多只是提供肥料磷與鉀素的效能而已。一般使用亞磷酸的方式是利用育苗期間作全株噴灑，或在定植後作全株噴灑作業，並且要掌握每七天一次，連續三次的噴灑間隔，以刺激作物產生防禦能力，幼苗噴灑時，應該注意苗株的齡期至少要達到三枚本葉的階段，而苗株作防護噴灑時不應該把稀釋濃度隨意提高，避免高磷效應造成苗株老化的問題產生，而成株的施用亦可依季節的變化重複處理。