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屬於腐植酸家族中的黃腐酸是應用極為廣泛的天然萃取物質，目前應用於營養劑的使用範圍極廣泛，除了常見的根系澆灌以外，也可以與各類葉面噴灑型態的營養劑混用，作為葉面肥施用。而黃腐酸可以跟大部分常見作物所需微量元素螯合的作用，所以具有高效能的吸收增效作用，並針對作物在於氮、磷、鉀、鈣、鎂等必須元素的吸收作用的提升更是有益，肥料利用性提高，也代表肥料的使用量可以降低；而具有天然活性作用的特質，對於作物根系的發展是有絕對的優化效益，因此更可以提高生長態勢。
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腐植酸因為需要使用鹼液去做萃取，所以如前提，腐植酸在選擇時需了解所使用的鹼液的成分為何，如果是含有鈉離子的腐植酸，則需擇對鈉元素有高耐受性的作物，不然對於含有鈉離子的腐植酸在使用上必須謹慎小心，或避免使用。而其餘如帶鉀離子的腐植酸產品施用到土壤後，對作物的根系發育有加成作用。在使用的時候，如果要配合其他肥料的使用應該是要依照實際的產品物質含量去修正肥料添加物種類與濃度。而黃腐酸可以應用的方向較為廣，但粉劑易潮化，使用液態調配劑在使用與貯存會更加便利。
腐植酸的使用時機是屬於比較隨機，或者可以說在整個栽培時間，都是可以依照作物的生長現狀與土壤的物理化學性質去做使用頻度的調整；又夏季高溫可能造成有機物的快速分解之栽培時期也可以增加使用頻度。而腐植酸本身除了礦區或商品化的過程可以能含有某些無機鹽類以外，理論上腐植酸是不具有任何的肥效，也就是多施用可能是造成酸鹼度的短暫時間之改變以外，不會造成耕地的鹽度提高，但如果是含有無機鹽類的成分配方，就應該依照使用推薦施用，避免過度的鹽類堆積造成作物根系的損傷。
常見的腐植酸產品在使用上，可以單獨使用亦可以依照實際上的需求，混合多種肥料或農藥使用，當然不同藥品或肥料等在合乎指示的單獨使用情況下都是絕對的安全，但是在混合使用的情況則可能因為藥劑間的混合成分的差異而有可能造成不同程度的影響，所以混合使用前都應該做小範圍的測試以免造成藥害。腐植酸的建議使用時機點大致如下，如果是使用粉狀或顆粒狀者可以在翻土時充分混合於土壤中，待灌溉充水後，使其在土壤根圈位置提供有益根系發育的條件；而使用液劑可以透過噴灑或澆灌使用。
腐植酸是一種混合型的物質，包含固態與液態等多種性狀型態的商品化產物。而在使用上常見為混拌在土壤中作為基肥的混合物，而另一種則為濃縮萃取液，可以依照萃取過後的品質差異，又分為可以做為葉面噴灑用者或只能土壤灌溉者。固體化的腐植酸產品也會因為品質的細緻度，分為可以充分溶解用於噴灑用的或類似泥炭土只能作為介質混拌物。不管是哪種性狀型態的腐植酸產品在使用的目的都是相差不遠，腐植酸在使用後可以作為短期間的根圈發育改善，而且可以優化土壤的理化條件，使植株生長旺盛。